Skóra:
Najwcześniejszym objawem mogą być białe plamki (odbarwienia), zwłaszcza na kończynach i korpusie, czasem widoczne od urodzenia. Nie sprawiają kłopotów i często później znikają. Poza tym, czerwone lub brązowe „znamiona wrodzone” – nieraz na twarzy lub czerwonawe, woskowate zmiany na czole. U dziecka, z wiekiem objawy skórne mogą się rozwijać, np. w charakterystyczną wysypkę na twarzy (angiofibroma), na policzkach i nosie, jak „motyl”. Zaczyna się od małych, czerwonych plamek, które następnie stają się guzkami, a czerwień zanika. W okresie dojrzewania lub później, wokół paznokci palców rąk i nóg mogą się tworzyć niewielkie włókniaki lub guzki. Innym objawem skórnym może być szagrynowa (skóra rekina) plama u dołu pleców. Ma barwę cielistą i wygląda jak skóra pomarańczy.

Serce:
Sercowe mięśniaki prążkowanokomórkowe (łagodne guzy serca) to jeszcze inny objaw SG. Mogą się pojawiać u płodu i można je wykryć przed urodzeniem.
Rzadko stanowią problem i często cofają się, a nawet zanikają po urodzeniu.

Padaczka:
Ataki mają miejsce u ok. 70% osób z SG. Mogą się pojawić w dowolnym wieku, ale często w dzieciństwie, często w pierwszym roku życia. Zaczynają się często jako napady zgięciowe, które powinny być leczone natychmiast. Z czasem ataki te mogą się zmieniać, a nieraz zupełnie znikają. Prawdopodobnie w przypadkach SG przyczyną tych ataków są guzy korowe.

Opóźnienia rozwoju:
Ok. 40–50% ludzi z SG posiada normalną inteligencję, natomiast reszta ma trudności z uczeniem się i rozwojem, od przypadków łagodnych do poważnego kalectwa u 20%.  Zalecana jest wczesna interwencja.

Zachowanie:
Ok.25% osób z SG cierpi na autyzm, a następne 25% przejawia zaburzenia autystyczne, w tym autyzm wyższych funkcji. U dzieci występuje często niedobór uwagi, nadmierna ruchliwość, natomiast u dorosłych częściej występują paranoja, depresja i niepokój. Zaburzenia snu są dokuczliwe i zwykle kojarzone z padaczką.

Nerki:
Nieraz u noworodka występuje wielotorbielowatość nerek, nabywana przed narodzenie lub wkrótce po, a dalsze badania prowadzą do diagnozy SG.
U około 70–80% osób z TS nerki rozwijają się nienormalnie, lecz często nie daje to żadnych objawów, zwłaszcza w dzieciństwie.

Kryteria diagnostyczne stwardnienia guzowatego

Kryteria większe
	Lokalizacja	Objaw	Wiek wystąpienia	Uwagi
1	Głowa	Angiofibromata twarzy lub płaskie włókniaki okolicy czoła	Niemowlęctwo – dorosłość
2	Palce dłoni i stóp	Niepourazowe, okołopaznokciowe włókniaki (guzki Koenena)	Pokwitanie – dorosłość
3	Skóra	Plamy hipomelanotyczne	Niemowlęctwo – dzieciństwo	Więcej niż 3
4	Skóra	Plamy szagrynowe (znamiona łączące)	Dzieciństwo
5	Mózg	Guzy korowe mózgu	Życie płodowe	5 i 15 razem liczone jako jedno kryterium większe.
6	Mózg	Guzki podwyściółkowe mózgu	Dzieciństwo – pokwitanie
7	Mózg	Podwyściółkowy gwiaździak olbrzymiokomórkowy	Dzieciństwo – pokwitanie
8	Gałka oczna	Liczne guzkowate zmiany hamartomatyczne siatkówki	Niemowlęctwo
9	Serce	Rhabdomyoma serca	Życie płodowe	Pojedyncze lub mnogie
10	Płuca	Limfangioleiomiomatoza	Pokwitanie – dorosłość
11	Nerki	Naczyniomięśniakotłuszczak nerki (angiomyolipoma)	Dzieciństwo – dorosłość	10 i 11 razem liczone jako jedno kryterium większe.
Kryteria mniejsze
	Lokalizacja	Objaw	Uwagi
12	Zęby	Liczne losowo rozmieszczone dołki w szkliwie
13	Odbytnica	Hamartomatyczne polipy odbytnicy	Sugerowane jest potwierdzenie histopatologiczne.
14	Kości	Torbiele kości
15	Mózg	Ogniska migracji istoty białej mózgu	Wystarczające jest rozpoznanie radiologiczne. 5 i 15 razem liczone jako jedno kryterium większe.
16	Dziąsła	Włókniaki dziąseł
17	Wątroba, śledziona i inne narządy	Hamartoma (pozanerkowe)	Sugerowane jest potwierdzenie histopatologiczne.
18	Gałki oczne	Obszar siatkówki pozbawiony barwnika
19	Skóra	Ogniskowe zmiany skórne typu "confetti"
20	Nerki	Liczne torbiele nerki	Sugerowane jest potwierdzenie histopatologiczne.